O Ensino Médio do Colégio Agostiniano Mendel tem por princípios pedagógicos a transmissão de valores humanos tais como, responsabilidade e senso crítico, possibilitando ao aluno a construção de uma grande bagagem cultural.
Com um ensino de qualidade, resultado de metodologias adequadas aos conteúdos necessários, objetivamos capacitar o aluno para ingressar nas melhores Instituições de Ensino Superior, (públicas ou privadas).
Assim sendo, cada série do Ensino Médio tem um objetivo específico, a saber:
1ª série: Caracterizada pela transição entre o Ensino Fundamental e o Ensino Médio propriamente dito, privilegia no primeiro momento, um trabalho de acolhimento e socialização, objetivando adaptar o aluno à nova fase escolar. Posteriormente, concluída a inserção do aluno no universo do Ensino Médio, inicia-se o projeto pedagógico que ao longo das três séries irá desenvolver os conteúdos programáticos previstos pela grade curricular.
2ª série: Na segunda série, ocorre a intensificação dos conteúdos programáticos e dá-se inicio ao processo de orientação profissional, oferecendo ao aluno as ferramentas necessárias para que possa fazer a sua opção profissional de forma consciente.
3ª série: Na terceira série, entendendo o aluno mais preparado e maduro para a aquisição de conhecimentos, são oferecidas aulas optativas de Biológicas (Medicina), Humanas (Direito) e Exatas (Engenharia), além de plantões de Redação, os quais associados a simulados instrumentalizam o aluno nos campos cognitivo e emocional, tornando-o apto para a exigência dos grandes vestibulares nacionais.